Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Hpf1Q8CFE2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hpf1Q8CFE2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Hpf1Q8CFE2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Hpf1Q8CFE2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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Hpf1Q8CFE2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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