Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc159Q8C963 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms