Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1W1

Vash1, Vasohibin-1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vash1Q8C1W1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Vash1Q8C1W1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Vash1Q8C1W1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Vash1Q8C1W1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Vash1Q8C1W1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Vash1Q8C1W1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Vash1Q8C1W1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Vash1Q8C1W1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Vash1Q8C1W1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Vash1Q8C1W1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Vash1Q8C1W1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Vash1Q8C1W1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Vash1Q8C1W1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vash1Q8C1W1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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