Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22cQ8BXT9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22cQ8BXT9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22cQ8BXT9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22cQ8BXT9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22cQ8BXT9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22cQ8BXT9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22cQ8BXT9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22cQ8BXT9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22cQ8BXT9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22cQ8BXT9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec22cQ8BXT9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms