Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Best2Q8BGM5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms