Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg4cQ811C2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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