Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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