Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms