Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LnpkQ7TQ95 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms