Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms