Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms