Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TwistnbQ78WZ7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms