Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms