Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Asic3Q6X1Y6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Asic3Q6X1Y6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Asic3Q6X1Y6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Asic3Q6X1Y6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Asic3Q6X1Y6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asic3Q6X1Y6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asic3Q6X1Y6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asic3Q6X1Y6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asic3Q6X1Y6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asic3Q6X1Y6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asic3Q6X1Y6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asic3Q6X1Y6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asic3Q6X1Y6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asic3Q6X1Y6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asic3Q6X1Y6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asic3Q6X1Y6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms