Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms