Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms