Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc154Q6RUT8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc154Q6RUT8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms