Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE7

Slc6a7, Sodium-dependent proline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a7Q6PGE7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a7Q6PGE7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms