Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HjurpQ6PG16 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms