Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms