Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trak1Q6PD31 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trak1Q6PD31 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms