Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms