Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo27Q6DIA9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo27Q6DIA9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo27Q6DIA9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo27Q6DIA9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo27Q6DIA9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo27Q6DIA9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo27Q6DIA9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo27Q6DIA9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms