Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usf2Q64705 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usf2Q64705 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms