Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ss18Q62280 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ss18Q62280 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ss18Q62280 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ss18Q62280 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ss18Q62280 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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