Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prm3Q62100 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prm3Q62100 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms