Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gp49aQ61450 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gp49aQ61450 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms