Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxf1Q61080 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms