Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms