Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJG7

Ispd, D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IspdQ5RJG7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IspdQ5RJG7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IspdQ5RJG7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms