Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH7

Slc38a8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a8Q5HZH7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms