Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam208bQ5DTT3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms