Protein–RNA interactions for Protein: Q4QY32

Gm6040, Beta-defensin 51, mousemouse

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Length 63 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6040Q4QY32 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6040Q4QY32 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6040Q4QY32 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6040Q4QY32 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6040Q4QY32 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6040Q4QY32 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6040Q4QY32 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6040Q4QY32 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6040Q4QY32 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6040Q4QY32 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6040Q4QY32 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6040Q4QY32 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6040Q4QY32 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6040Q4QY32 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6040Q4QY32 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6040Q4QY32 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6040Q4QY32 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6040Q4QY32 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms