Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms