Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms