Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms