Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms