Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms