Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms