Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms