Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms