Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms