Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gata4Q08369 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms