Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NrepQ07475 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NrepQ07475 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms