Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms