Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms