Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms