Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox12Q04890 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms