Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms