Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms